Kejadian mengerikan itu berawal pada 20 tahun, tepatnya pada tahun 2003. Saat itu, ditemukan sebuah virus yang berasal dari jamur. Para korban yang terinfeksi lantas mejadi haus darah dan bisa menginfeksi orang lain.
Kekacauan tersebut kemudian memicu pandemi global. Joel berhasil melarikan diri dari virus yang mengintai bersama dengan anaknya, Sarah. Keduanya sempat diserang oleh militer namun naas Sarah tewas. Joel kemudian berhasil selamat usai membantu adiknya, Tommy (Gabriel Luna).
Kesepakatan Antara Joel dengan Fireflies
20 tahun kemudian, Joel tinggal di area karantina di Boston yang dijaga ketat oleh Badan Penanggulangan Bencana Federal (FEDRA).
Tak hanya berdiam diri, Joel tinggal bersama dengan rekan penyelundupannya yakni Tess (Anna Torv). Hingga kemudian, Tommy kesulitan untuk menghubungi Joel dan Tess. Mereka rupanya sedang berusaha membeli aki mobil dari dealer untuk dijual kembali ke kelompok pemberontak dari FEDRA, Fireflies.
Joel dan Tess namun menghadapi masalah baru. Pemimpin Fireflies memberikan penawaran untuk menyuruh Joel dan Tess membawa Ellie ke Massachusetts State House dan nantinya akan diberikan imbalan. Sempat diremehkan, rupanya pekerjaan mengawal Ellie bukan lah hal yang mudah. The Last of Us ini memiliki 9 episode.