Rabu, 4 September 2024
Hari kedua kunjungan, 4 September 2024, akan dimulai dengan upacara selamat datang di pelataran Istana Merdeka. Paus Fransiskus dijadwalkan untuk melakukan kunjungan kehormatan kepada Presiden Republik Indonesia di Istana Merdeka. Pertemuan ini akan diikuti dengan pertemuan bersama kalangan pemerintahan, masyarakat sipil, dan korps diplomatik di Aula Istana Negara.
Selanjutnya, Paus Fransiskus akan mengadakan pertemuan pribadi dengan anggota Serikat Jesus (SJ) di Kedutaan Besar Vatikan. Beliau juga akan bertemu dengan para uskup, imam, diakon, pelaku hidup bakti, seminaris, dan katekis di Gereja Katedral Santa Maria Diangkat ke Surga.
Hari tersebut akan ditutup dengan pertemuan bersama kaum muda Scholas di Grha Pemuda.
Kamis, 5 September 2024
Pada 5 September 2024, Paus Fransiskus akan menghadiri pertemuan antaragama di Masjid Istiqlal, Jakarta, yang merupakan simbol penting dari dialog antaragama di Indonesia.
Selain itu, Paus Fransiskus akan bertemu dengan penerima manfaat dari berbagai organisasi amal di Kantor Pusat Konferensi Waligereja Indonesia.