Setelah putus dari Primus Yustisio, Nafa Urbach berpacaran dengan Zack Lee. Singkat cerita, hubungan keduanya sampai ke jenjang pernikahan. Nafa dan Zack menikah pada 16 Februari 2007 di Gereja Immanuel Jakarta. Sebelum menikah, Nafa dirumorkan kembali pindab ke agama semula yakni Kristen.
Dari pernikahannya dengan Zack Lee, Nafa Urbach melahirkan anak perempuan yang bernama Mikhaela Lee Jowono pada 8 Februari 2011. Tetapi, rumah tangga Nafa dan Zack harus berakhir dengan perceraian pada tahun 2017. Walau demikian, keduanya masih akur dan bertekad membesarkan Mikhaela seperti keluarga utuh.
3. Publik Bertanya-tanya
Tidak pernah klarifikasi soal agamanya, publik bertanya-tanya kepada Nafa Urbach. Nafa seolah menyatakan netizen kerap bertanya soal kebenaran apakah dirinya pindah agama hingga kapan telah pindah keyakinan.
Dalam pengakuannya, Nafa Urbach bahkan mengklaim beberapa netizen terlibat perdebatan karena mempertanyakan agama yang dianutnya.